本會源自民國40年代天主教聖母聖心會來台草創開始，至民國90年7月正式立案正名為「財團法人天主教光仁社會福利基金會」，其發展可分為二個階段：

1. 天主教聖母聖心會時期（民國40年至77年）
   民國40年代，一批聖母聖心會比利時籍神父在臺北市、臺北縣、臺中市等地展開福傳工作，於民國60年有感社會的需要，開始辦理啟智工作，這在臺灣是屬於開路先鋒的服務。
2. 天主教台北總教區時期（民國77年迄今）
   民國70年代初，聖母聖心會評估在臺灣的人才已培養成熟，開始著手將在臺北、臺中等地所創辦之文教事業及社會福利事業，逐漸將經營權轉移給當地修會及教區。民國77年，乃正式將文教事業及社會福利事業轉移給當地教區，臺北教區則成立光仁文教基金會，於教育部立案，接管經營所屬幼稚園、學校、社會福利事業等單位。
3. 光仁社會福利基金會時期（民國90年7月起～）
   （1）成立天主教光仁文教基金會（民國77年至90年）
   民國70年代初，聖母聖心會評估在臺灣的人才已培養成熟，開始著手將在臺北、臺中等地所創辦之文教事業及社會福利事業，逐漸將經營權轉移給當地修會及教區。民國77年7月28日天主教聖母聖心會創辦及經營之教育與社會福利事業（包括光仁中學、光仁小學、育仁啟智中心、育仁啟能中心、育仁幼稚園、世仁幼稚園、天仁幼稚園、天心托兒所、三芝幼稚園、快樂兒童中心、懷仁中心在內） 正式轉移與天主教台北總教區。成立天主教光仁文教基金會並於教育部立案，接管經營所屬幼稚園、學校、社會福利事業等單位。
   
   （2）成立天主教光仁社會福利基金會（民國90年7月起～）
   民國86年，教育部來函天主教光仁文教基金會表達，社會福利機構團體非屬教育部；文教基金會董事會亦評估另行成立社會福利基金會的可能性。經近三年的規劃與籌備，於民國90年7月經內政部核准立案，並透過行政程序，逐步將原屬天主教光仁文教基金會之社會福利機構轉由另外成立之天主教光仁社會福利基金會管理經營。