本館董事長林清富先生本著關懷台灣本土文化之情，以順益企業創始人林迺翁先生之名，於1985年成立「財團法人林迺翁文教基金會」，籌建「順益台灣原住民博物館」，將其20年來所收藏之原住民族文物贈與博物館，具體實現了「取諸社會，還諸社會」的心意。博物館以林清富先生所捐贈之文物為基礎，開啟了田野訪談及學術研究工作，持續蒐藏海內外的台灣原住民族文物，並接受熱心人士捐贈，現已累積收藏文物1700餘件。

為提倡台灣原住民族文化研究風氣，本館自籌備期間即已陸續提撥經費贊助相關研究，如：1991年與國立台灣大學人類學系簽署民族學標本資料匯整計畫，加強維護該系之珍貴文物；1993年公佈原住民文化研究出版獎助辦法，提供國立台灣大學、政治大學與清華大學等三校原住民研究生獎學金，以培育優秀本土原住民人類學者；另外，博物館也贊助多項原住民相關議題之學術研討會及文化活動。除了推動本土文化研究，本館也贊助美國加州大學柏克萊分校、日本東京大學、英國牛津大學、荷蘭萊登大學等研究經費，匯整各國之早期台灣資料及相關研究成果，以供中外人士參考使用。

博物館於1994年6月正式開幕，除了積極從事台灣原住民族文物蒐藏保存、研究之外，也藉由多樣化的教育活動促進台灣原住民族文化的推廣，館內的常設展及特展忠實呈現了台灣原住民族的豐富的物質文化。

此外，為尊重原住民族對自身文化的詮釋權，每年的「與部落結合」特展，採取與單一族群部落合作的方式，共同規劃特展內容，彰顯獨特族群的主體性，提供原住民族文化展演的場域，使博物館成為多元文化的發聲管道及論壇。

順益台灣原住民博物館已跨過第一個十年，無論是籌備處或開館期間皆蒙受社會多方支持，未來，博物館將繼續在這塊領域努力，積極推廣台灣原住民族文化，增進各族群間彼此的瞭解及尊重，擴展人文關懷視野，呈現台灣本土文化的多元樣貌，衷心期待各界的指教！